選擇性剪切是一種重要的調(diào)控機(jī)制,能夠增加轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組的多樣性。近年來基因組水平的研究極大地拓展了研究人員對(duì)植物中選擇性剪切發(fā)生頻率的估計(jì)。最新的研究發(fā)現(xiàn)超過60%的含有內(nèi)含子的基因可以發(fā)生選擇性剪切。但是選擇性剪切得到的mRNA可能僅僅是不完善加工的前體mRNA。研究人員仍不知道有多大比例的選擇性剪切事件可以導(dǎo)致蛋白質(zhì)組的多樣性。
中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所焦雨鈴研究組在全基因組水平通過分析與核糖體結(jié)合的mRNA來研究翻譯組的構(gòu)成,并與總mRNA所代表的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了比較。該研究發(fā)現(xiàn)有35%的選擇性剪切事件能夠被翻譯,并且其中大部分(81%)會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)編碼能力的多樣化。同時(shí),該研究發(fā)現(xiàn)一些弱翻譯的選擇性剪切mRNA可能通過無(wú)義介導(dǎo)的mRNA降解途徑降解,非翻譯的選擇性剪切mRNA則不通過此途徑降解。該研究報(bào)道了植物選擇性剪切對(duì)蛋白質(zhì)組多樣性的貢獻(xiàn),并分析了植物與動(dòng)物中可變剪切的區(qū)別。
該研究成果于5月2日發(fā)表于《分子植物》(Molecular Plant)(DOI: 10.1016/j.molp.2015.12.018)。該項(xiàng)目得到了科技部、自然科學(xué)基金委及植物基因組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的資助。焦雨鈴研究組的博士研究生于浩澎和副研究員田彩環(huán)為該文章的共同第一作者。
選擇性剪切對(duì)蛋白質(zhì)多樣性的作用