家豬毛色表型常作為易察覺(jué)的外型特征,在品種選育中起重要作用。六白(四蹄、頭和尾尖白色)是一種家豬中常見(jiàn)的毛色類型,在不同的歐亞家豬品種中均有發(fā)現(xiàn)。前人的研究揭示歐洲家豬出現(xiàn)的六白毛色與MC1R基因的插入突變緊密相關(guān),但對(duì)有著不同馴化起源的中國(guó)家豬來(lái)說(shuō),這一表型的形成機(jī)制至今并不清楚。在滇南小耳豬中,六白毛色占有很高比例,并且大量個(gè)體出現(xiàn)了不完全六白的特征,給該家豬品種的選育過(guò)程帶來(lái)了困難。
為了解決這一科學(xué)問(wèn)題,中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所分子進(jìn)化與基因組多樣性研究課題組利用二代測(cè)序技術(shù),對(duì)17頭具有六白毛色表型和14頭全黑表型的滇南小耳豬進(jìn)行了全基因組測(cè)序;利用比較基因組學(xué)的分析手段,并結(jié)合大規(guī)模群體基因分型驗(yàn)證,從分子層面上揭示了調(diào)控滇南小耳豬六白毛色的遺傳機(jī)制。研究結(jié)果顯示,滇南小耳豬的六白毛色并非由于MC1R基因的突變導(dǎo)致,而是受到多個(gè)基因共同調(diào)控的復(fù)雜性狀;CNTLN、PINK1和EDNRB三個(gè)基因組的變異共同解釋了滇南小耳豬群體中約20%的毛色表型變異;在六白個(gè)體中,EDNRB基因上有一段跨物種保守的CEBPB識(shí)別motif發(fā)生突變,可能導(dǎo)致了基因表達(dá)的改變。該研究拓展了對(duì)家豬馴化過(guò)程中毛色變異調(diào)控機(jī)制的認(rèn)識(shí),并且對(duì)滇南小耳豬的選育具有重要指導(dǎo)意義。
目前該研究成果已發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊Scientific Reports上,昆明動(dòng)物所博士研究生呂夢(mèng)蝶和韓徐曼為共同第一作者,張亞平和謝海兵為共同通訊作者。
該項(xiàng)研究工作得到了國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、科技部“973”計(jì)劃等項(xiàng)目的支持。